Atena została wyróżniona za umiejętności w zakresie implementacji i wdrażania rozwiązań bazujących na technologiach Microsoft. Jednym z istotnych warunków uzyskania statusu Gold Certified Partner była realizacja przez Atenę określonej liczby złożonych projektów wdrożeniowych w firmach z sektora ubezpieczeń i finansów.
Atena oferuje usługi w zakresie wdrażania systemów bazujących na technologii Microsoft, między innymi opartych na Windows Server 2003, MS SQL, MS BizTalk Server, MS Exchange Server. W 2005 roku Atena prowadziła projekty migracyjne w zakresie wdrożenia Active Directory obejmujące wymianę i konsolidację serwerów Exchange 2003, upgrade serwerów i kontrolerów domeny do Windows Server 2003 oraz systemów operacyjnych stacji roboczych do Windows XP. Atena jest autorem platformy wymiany danych finansowych Jazon, jednego z zastosowań technologii MS BizTalk Server w instytucjach finansowych w Polsce.